ד"ר פנינה שוקר היא מומחית לסוגיות של ביטחון לאומי, דעת קהל ומדיניות חוץ. פנינה הינה פוסט דוקטורנטית בביה"ס למדע המדינה, ממשל ויחסים בינלאומיים באוניברסיטת תל אביב ומשמשת כעורכת משנה של כתב העת Jerusalem Strategic Tribune. כמו כן, היא משמשת כמרצה באוניברסיטת בר-אילן והמרכז האקדמי שערי מדע ומשפט. בעברה, שימשה כחוקרת (מלגאית ניובאואר) במכון למחקרי ביטחון לאומי וכמנהלת התכניות הבינלאומיות של מרכז דיין ללימודי המזרח התיכון ואפריקה. עבודת הדוקטורט שלה נכתבה במחלקה למדע המדינה באוניברסיטת בר-אילן, בנושא "תפיסת החברה הדמוקרטית כרגישה לנפגעים והשפעתה על ההתמודדות עם איומים אסטרטגיים: ארצות הברית, בריטניה וישראל בניתוח השוואתי".